El Colegio Yachay Wasy “Leonardo da Vinci” se organiza en tres niveles de enseñanza:
Nivel Inicial: Pre-Kinder y Kinder
El colegio desarrolla sus actividades académicas de lunes a viernes en el horario de la mañana desde las 08:00 hasta las 12:00
Nivel Primario: 1º a 6º grados
El colegio desarrolla sus actividades académicas de lunes a viernes en el horario de la mañana desde las 08:00 hasta las 13:00
Nivel Secundario: 1º a 6º grados
El colegio desarrolla sus actividades académicas de lunes a viernes es desde las 08:00 hasta las 16:00 y el sábado de 8:00 a 12:00 donde se dedica a las actividades complementarias relacionados con el tema edagógico, deportes, actividades artísticas y culturales y otras)
Los alumnos cursan en los dos últimos años el bachillerato diversificado en las áreas de Ciencias Sociales, Ciencias Exactas y Ciencias Biológicas.